Bäuerle erlernte das Uhrmacherhandwerk und arbeitete zunächst in verschiedenen Uhrenfabriken im Schwarzwald. Später gründete er zusammen mit seinem Bruder eine eigene Uhrenfirma, die sich auf die Herstellung von Präzisionsuhren spezialisierte.
Während des Zweiten Weltkriegs produzierte die Firma Bäuerle & Söhne Uhren für die Wehrmacht, wurde aber nach dem Krieg schnell wieder zu einem zivilen Uhrenhersteller.
In den folgenden Jahren entwickelte die Firma weitere innovative Uhrentechnologien, darunter die Verwendung von Quarz in Uhren und die Herstellung von Taucheruhren.