Neben dem üblichen Molkenprotein Konzentrat gibt es noch andere Darreichungsformen von Proteinen. Durch die jeweiligen Filtrierungsverfahren in der Produktion ergeben sich hier unter anderem Unterschiede in Zucker/Fett oder auch Proteingehalt. Auch Begleitstoffe oder Rückstände der Urformen der jeweiligen Proteinart können hierbei herausgefiltert werden.

Durch das sogenannte Ultrafiltrierungsverfahren entsteht das Molkenprotein-Isolat. Isolat ist vor allem für weniger Zucker und Fettanteil sowie einen höheren Proteinanteil bekannt. Durch das Ultrafiltrierungsverfahren werden außerdem auch die letzten Laktoserückstände herausgefiltert, wodurch sich eine viel bessere Verträglichkeit ergibt. Gerade deshalb ist Isolat auch für Laktoseintolerante oft das Protein der Wahl.